29. BOLUMENA, 4. ALEA • 2025EKO ABENDUA.
2025 Mugimenduaren nahasteak Urteko Berrikuspen Artikulua
Neuroendekapenezko gaixotasunen esplorazioa irakurketa luzeko sekuentziazioa eta genoma-mapaketa optikoko teknologiak erabiliz
Oso pozik gaude "2025eko Urteko Berrikuspen Artikulua" saria jaso dugulako. Mugimenduaren nahasteak aldizkaria. Aurkeztu ondoren Mugimenduaren nahasteak PRKNrekin lotutako Parkinson gaixotasunarekin (PD) bateragarria den fenotipoa duten bi anai-arreba deskribatzen dituen artikulu batean, irakurketa luzeko sekuentziazioaren (LRS) bidez konponduta, erredakzio-buruak atsegin handiz gonbidatu gintuen genetista ez den publikoarentzat teknologia berrietan oinarritutako berrikuspen bat idaztera.
Uste dugu berrikuspen hau une egokian iritsi dela bi arrazoirengatik. Lehenik eta behin, gero eta jende gehiagok erabiltzen du LRS gaixotasun neurodegeneratiboen testuinguruan, eta literaturatik gero eta ebidentzia gehiagok frogatzen du exoma osoaren edo genoma osoaren irakurketa laburreko sekuentziazioaren bidez azaldu ezin diren kasuak konpontzeko duen gaitasuna. Bigarrenik, azken berrikuspena 2021ean argitaratu zuen Su et al.-ek Neurology aldizkarian, beraz, eguneratze bat beharrezkoa zela iruditu zitzaigun. Pozik onartu genuen idazkia, eta LRSren eta genoma optikoaren mapaketa (OGM) lorpen berrien ikuspegi zabala eskaintzea izan zen gure helburua, baita haien mugak, erronkak eta etorkizunerako aukerak ere.
Giza ezaugarrietan eragina duten hiru aldaera genetiko mota nagusi daude: aldaera txikiak (50 base-pare baino gutxiago dituzten aldaerak, nukleotido bakarreko aldaerak eta txertaketak/ezabaketak ere deituak), errepikapen tandem laburrak (errepikapen-hedapen RE gisa ere ezagunak) eta aldaera estrukturalak (SVak, ezabaketak, txertaketak, bikoizketak, inbertsioak, translokazioak). Nahasmendu monogeniko askok oraindik ez dute diagnostiko molekular zehatzik, batez ere sekuentziazio-metodo konbentzionalak ez direlako eraginkorrak SVak eta REak detektatzeko, biak baitira gaixotasun neurogenetiko askotan kausatzaileak. Hori dela eta, hainbat ekimenek LRS eta/edo OGM erabiltzea dute helburu gaixotasun neurodegeneratiboen oinarri genetikoak deszifratzeko. Hainbat adibide zabal eman ditugu berrikuspenean, irakurleari LRS eta OGMren lorpenak ulertzeko. LRS-k nola ahalbidetu digun neuroendekapenezko gaixotasun ezagunetan (adibidez, PRKN, SPG4) irakurketa laburreko sekuentziazioak deitzen ez dituen aldaerak agerian uztea eta kausa-gene berriak aurkitzea aztertzen dugu (adibidez, neurona barneko inklusio-gaixotasuna eta NOTCH2NLC 5'UTR hedapena, 4 motako ataxia espinocerebelarra eta ZFHX3). Halaber, LRS-k errepikapenen tamaina eta motiboa karakterizatzeko duen gaitasuna erakusten dugu, eta horrek eragina du agerpen-adina, penetrantzia, herentzia eta fenotipo klinikoetan (CANVAS eta RFC1, FXTAS eta FMR1, SCA27B eta FGF14). Halaber, LRS erabiliz aldaerak faseatzeko aukera deskribatzen dugu, eta geneetako aldaerak beren pseudogenean daudenetatik bereizteko aukera (GBA1, SORD2), baita transkripzio berriak identifikatzeko aukera ere. Halaber, SV eta REen identifikazioan genoma-mapaketa optikoaren alde onak eta txarrak azpimarratzen ditugu. Teknologia hauek oraingoz ikerketa-inguruneetan erabiltzen diren arren, etorkizunean laborategi klinikoetan inplementazio zabalagoa aurreikusten dugu. Espero dugu berrikuspen hau profesionalentzat lagungarria izatea haien erabilgarritasuna eta mugak ulertzeko eta zentzuz erabiltzeko, bai diagnostikoaren bai ikerketaren testuinguruan!
Entzun artikulu honi buruzko podcast elkarrizketa bat:
Entzun orain